孔子的後裔只是有一支去了臺灣，還有一隻留在了大陸，不過大陸的這支因為時政原因迅速的敗落而不為人之而已。這種兩邊下注的行為也十分符合大家族的做法，畢竟無論哪方勝利了對孔家人都影響不大。而孔家的分支能跟蔣介石去臺灣與孔家的歷史有關。

孔子嫡長孫自漢朝開始便被歷朝歷代的皇帝封官或封衍聖公，一般都是專管祭孔之事，民國時期國民政府封孔子第七十七代嫡長孫孔德成為“大成至聖先師奉祀官”，既然是國民政府的官員跟著政府遷至臺灣是理所應當之事。而且臺灣官方至今仍堅持每年的祭孔儀式，從未間斷。

兩岸破冰後，孔德成還擔任了山東曲阜師範學校名譽院長和山東曲阜孔子研究院永久榮譽院長。在臺灣，孔德成繼續享受世襲特任官的待遇，月薪約3~4萬人民幣。他的唯一工作，便是每年在9月28日孔子誕辰紀念日，負責參加臺北孔廟的祭典。目前在臺灣地區大概還有3000多位孔子後人。