二者的主要區別如下：

第一、結構上不同：果糖是與葡萄糖分子結構類似的單醣；蔗糖是由兩個葡萄糖的分子結構縮合脫水而成的雙醣。

第二、來源上不同：果糖來源於蜂蜜和水果的汁水中；蔗糖來源於植物的花瓣、根莖、葉子、種子及果實等結構中。

果糖是蔗糖的組成物質，白色無定型，味甜，在水果中都含有豐富的果糖。果糖是單醣，能結合成蔗糖。而蔗糖也是白色晶體，味甜，主要從甘蔗和甜菜中提取，含量特別豐富，在日常食用的白糖或紅糖中都含有蔗糖。

蔗糖是雙醣，由一分子葡萄糖和一分子果糖組成。蔗糖多從甘蔗和甜菜中提取，這兩種水果中的蔗糖含量非常豐富。

果糖為單醣，葡萄糖也是單醣。

另：麥芽糖是雙醣，由兩分子葡萄糖組成。

果糖是單醣，是葡萄糖的同分異構體，可以在體內直接吸收代謝。蔗糖是一種雙醣，它有一分子的葡萄糖和一分子的果糖構成，食入蔗糖後，通常需要分解成葡萄糖和果糖後再被進一步消化代謝。