汽車空調系統有異味則需要處理，以下是常見的清理方式。

在即將到達使用冷空調的夏季之前需要對空調進行測試，如果在開啟空調後出現明顯的異味但能很快的消失，這種情況並不是嚴重，只是管道內有一定黴菌，清理的方式可以用最簡單的熱風清理。

車輛怠速時開啟車門保證有效通風，空調調整到制熱模式（關閉A/C）並且調整到最高制熱溫度，之後把風量調整到最大並且持續20~30分鐘。

足夠大的風量可以除塵、熱風可以起到乾燥並且抑制黴菌的作用，汽車暖風的熱量來自發動機冷卻液，冷卻液的溫度很高能夠帶來足夠大的熱量，長時間用熱風也能夠一定程度的清理黴菌。

大部分車輛使用這種方式可以有效去除異味而且能持續很長時間，不過夏季使用空調製冷會頻繁的出現黴菌，建議每隔2~3個月用這種方式清理一次。

如果異味嚴重使用熱風清理沒有明顯效果，首先要檢查空調濾芯是否過髒，如更換濾芯後能夠解決異味則不用其他方式，不可以的話再用專用清洗劑。

汽車空調清洗劑主要用以清理空調管道，使用的方式很簡單：清洗劑與自噴漆的原理相同，透過瓶內的壓力可以實現“自噴”，在噴射嘴的位置連線軟管之後伸入空調管道內部噴射。

每個個進氣口適量噴射一定比例的清洗劑，在等待5~10分鐘溶解之後開啟風機吹出異物即可。（注意不要避開用電的配置防止短路）

這種清洗方式比較簡單可以自行處理，不過使用這種清洗劑後要注意通風；這類清洗劑會有一定的清潔效果，但汽配後市場目前缺乏有效監管，這種清潔劑中是否含有對人體有害的物質沒有嚴格的測試。

所以在使用清潔劑後要以冷熱風交替的方式清理20~30分鐘，之後的一段用車時間內也要儘量開窗通風，直到沒有黴味也沒有清潔劑的味道即止。

假設以上兩種方式也不能起到絕對作用，最後的環節則是清理蒸發箱。

汽車空調蒸發箱的本質是一個熱交換器，在壓縮機的壓力下冷媒在蒸發箱內由液態變成氣態，這一蒸發的過程會吸收大量的熱從而降低空氣溫度。在冷熱溫度的頻繁切換中熱空會有部分產生液態水，這些水會讓蒸發箱內比較潮溼，而潮溼正是滋生黴菌的理想環境。

所以以上方式都無效的話，只有拆機清理蒸發器才能徹底解決；不過理論上進氣管道內部還有暖風水箱，高溫的冷卻液在進氣管道內是能夠有效烘乾並殺死黴菌的，20分鐘沒效果就堅持到40分鐘，以這種方式體驗過的清理效果還是比較理想的，拆洗蒸發箱的成本過高不是理想的選擇。

說明：汽車空調冷熱風共用一條管道，熱風時系統無需清理。