阿飛正傳主要劇情：

英俊不凡的旭仔阿飛（張國榮飾）是上海移民，他從未見過生母，自小由養母（潘迪華飾）養大，因此長大後他對生命中遇到的每一個女人都冷酷無情。放蕩不羈的他先後與南華體育會售票員蘇麗珍（張曼玉飾）和舞女咪咪（劉嘉玲飾）同居，但後來又相繼拋棄了她們。

旭仔從養母處得知，自己原是混著西班牙和菲律賓貴族血統的私生子旭仔決要找到生母，為此他隻身前往菲律賓，可是生母拒見，帶著怨恨離開。旭仔在離開香港前，將車子給予歪仔（張學友飾）。咪咪發現旭仔走了，問歪仔知不知道他在那裡，歪仔告訴她旭仔去了菲律賓，並將旭仔的車子賣掉，將錢給她去菲律賓找旭仔。

一直暗戀蘇麗珍的警察超仔（劉德華飾）目睹了蘇麗珍與旭仔的決裂，並在母親死後，決定改行去跑船。超仔在菲律賓唐人街又遇上了旭仔，不過他假裝自己不認識他。不久，旭仔因為買賣假護照而在一場毆鬥中身負重傷，超仔問他記不記得某年4月16日下午3時他在做什麼，旭仔說要記得的他永遠記得，但是他叫超仔告訴蘇麗珍他已經不記得了。最後他守著死在一列異國火車上的旭仔。在這同時，另一個阿飛（梁朝偉飾）精心打理自己準備出門，繼續上演著無腳鳥的故事 。

結局：旭仔在車上被人打了以後，然後死了。梁朝偉出現，代表一個阿飛死了，另一個阿飛站起來了。